Первоначальное название – кафедра статистики. Основана 29 октября 1969 года, выделившись из кафедры бухгалтерского учета и статистики (приказ № 621). Первым заведующим была кандидат экономических наук, доцент Наговицина Лидия Павловна.
Численность кафедры на момент образования насчитывала семь человек: Наговицина Лидия Павловна – зав. кафедрой; Ванина Мария Михайловна – старший преподаватель; Обичкина Майя Николаевна – ассистент; Бутримова Галина Александровна – ассистент; Надеждина Светлана Дмитриевна – ассистент; Путинцева Клара Филипповна – старший лаборант; Уварова Лидия Павловна – лаборант.
Двадцать четыре года название кафедры оставалось без изменения, однако значительные перемены произошли в ее кадровом составе. Заведующая кафедрой Наговицина Л.П. стала доктором экономических наук, профессором, получила звание заслуженного деятеля науки РФ. Бутримова Г.А. и Надеждина С.Д. стали кандидатами экономических наук, доцентами; Уварова Л.П. – старшим преподавателем. На протяжении этого периода в профессорско-преподавательском составе кафедры в разные годы работали: Стародубский Лев Всеволодович, к.э.н., профессор; Бобылева Маргарита Васильевна; Мороз Галина Лаврентьева, к.э.н., доцент; Рожкова Надежда Алексеевна; Милованов Дмитрий Александрович; Храмцова Татьяна Георгиевна, к.э.н., доцент; Гармаш Андрей Алексеевич, к.э.н., доцент; Терещенко Олег Вениаминович д.э.н., профессор; Воркунов Сергей Сергеевич; Суровцева Вера Александровна.
Начало перестроечного периода не могло не отразиться на составе кафедры. Переход на обучение на платной основе вызвал сокращение контингента и, как следствие, учебной нагрузки и штатной численности преподавателей. Но кафедра статистики продолжила свое существование. На 1 сентября 1992 года в ее составе осталось пять преподавателей: Наговицина Л.П., д.э.н., профессор, Бутримова Г.А., к.э.н., доцент; Мороз Галина Лаврентьева, к.э.н., доцент; Рожкова Надежда Алексеевна, старший преподаватель; Храмцова Татьяна Георгиевна, к.э.н., доцент.
В 1993 году кафедру статистики объединили с кафедрой экономики и размещения производительных сил и она стала называться кафедрой статистики и экономического прогнозирования. Преподавательский состав статистиков пополнился преподавателями присоединенной кафедры. Членами объединенной кафедры стали: Савельева Татьяна Михайловна, к.э.н., доцент; Савченко Николай Владимирович, к.г.н., доцент; Полканова Валентина Борисовна, д.г.н., профессор; Холодкова Виктория Владимировна, к.г.н., доцент; Ефремова Галина Михайловна; Шеина Зоя Ивановна. В объединенном виде кафедра просуществовала до 1995 года, когда произошло разъединение кафедр, кафедре вновь вернули ее старое название «Кафедра статистики», однако ненадолго. В сентябре 1996 года к кафедре статистики присоединили кафедру экономического прогнозирования. На кафедру пришли работать выпускники НГУ Бородко Наталья Викторовна и Ревуженко Анастасия Александровна.
Знаковой фигурой в истории кафедры следует считать Наговицину Лидию Павловну, руководившую кафедрой до 1998 года и освободившую должность заведующего в связи с переходом на должность проректора по научной работе. Однако Лидия Павловна оставалась профессором кафедры статистики по 2000 год. Благодаря неутомимой научной и педагогической деятельности Лидии Павловны на кафедре сформировался преподавательский коллектив, характеризующийся высоким научным уровнем, патриотическим отношением к университету, влюбленных в свою работу преданных статистиков, что позволило кафедре внести существенный вклад в подготовку специалистов университета.
Под руководством Наговициной Л.П., ее непосредственном участии и участии членов кафедры проведены крупные научно-исследовательские работы, такие как «Исследование платежеспособного спроса населения и его прогноз на перспективу по Сибири» (совместно с СО АН СССР с 1965 – 1968 г.); «Исследование пространственного размещения товарных запасов и их нормирования, в том числе для организаций потребительской кооперации районов Крайнего Севера и приравненных к ним областей, осуществляющих досрочный завоз товаров» (с 1967 года и по настоящее время по теме опубликовано 2 монографии (8 и 6 п.л.), 5 методик нормирование запасов, 2 лекции, 5 научно – исследовательских отчетов, статьи); «Экономика Сибири в разрезе широтных зон» (совместно с СО АН СССР с 1985 по 1992 годы); «Исследование численности, состава, обеспеченности, текучести кадров потребительской кооперации» (с 1982 года и по настоящее время опубликованы 2 методики определения потребности потребсоюзов в специалистах с высшим и средним специальным образованием, методика анализа обеспеченности потребсоюзов в кадрах, лекция).
Статистик российского значения, автор учебников по статистике советской потребительской кооперации, монографий, посвященных управлению товарными запасами, текстов лекций по статистике, Наговицина Л.П. всегда была идеологом идей, принципов и ценностей потребительской кооперации. С 2001 года она возглавила кафедру теории и истории кооперации.
С 1998 года по 2001 год кафедрой статистики и экономического прогнозирования руководил доктор экономических наук, профессор, член-корреспондент Россельхозакадемии Новоселов Юрий Анатольевич, освободивший должность заведующего в связи с переходом на должность проректора по науке. С его приходом на кафедру связано формирование научной школы экономического прогнозирования социально-экономических явлений и процессов.
С конца 2001 года по настоящее время кафедрой заведует доктор экономических наук, профессор Шаланов Николай Васильевич, внесший большой вклад в формирование современного кадрового состава кафедры.
Новейшая история кафедры характеризовалась расширением ее состава и увеличением числа читаемых дисциплин. Первые годы нового тысячелетия ознаменованы существенным омоложением кафедры: в 2001 году пришли работать Алетдинова Анна Александровна, к.т.н., доцент; Макурина Юлия Александровна, старший преподаватель; в 2003 году – Донецкая Светлана Сергеевна, к.э.н., доцент; в 2004 году – Перевощикова Татьяна Михайловна, старший преподаватель.
В 2011 г. произошло объединение кафедр статистики и экономического прогнозирования и высшей математики с присвоением названия кафедры статистики и математики.